Recombinant engineering bacterium for producing 2 '-fucosyllactose as well as construction method and application of recombinant engineering bacterium
A technology of fucosyllactose and recombinant engineering bacteria, applied in the field of genetic engineering, can solve the problems of cumbersome synthetic steps of chemical synthesis method, high cost of enzyme-catalyzed synthesis method, poor enzyme stability, etc. Efficient expression effect
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[0044]实施例1 Lac4缺陷型的马克斯克鲁维酵母的筛选
[0045]本实施例中,Lac4缺陷型的马克斯克鲁维酵母的构建,以野生型马克斯克鲁维(K.marxianus) KM-0(为现有技术中已公开的菌株,可从中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心购买得到,保藏编号为CGMCC NO.21978)为出发菌株,用HPT基因完全取代野生型马克斯克鲁维(K. marxianus)KM-0基因组中所有的Lca4基因,以此实现Lca4基因的敲除。
[0046]根据Lac4的启动子、终止子及HPT基因来源PMT015质粒序列信息,设计扩增引物,如表1所示(F-HPTcycle1, R-HPTcycle1, F-HPTcycle2, R-HPTcycle2);然后分别以PMT015质粒和野生型马克斯克鲁维(K. marxianus)KM-0基因组为模板,PCR扩增得到HPT基因片段、Lac4的部分启动子和Lac4的部分终止子,扩增条件为:预变性95℃ 5 min;变性95℃ 20 s,30个循环;退火55℃ 20 s,30个循环;延伸72℃ 1 kbp / 60 s,30个循环;最终延伸72℃ 10 min。所述HPT的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,其表达的潮霉素B的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述Lac4的部分启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;所述Lac4的部分终止子的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
[0047]常规方法构建得到重组基因片段:Lac4的部分启动子-HPT-Lac4的部分终止子,称之为HPTT。将该重组基因片段转入野生型马克斯克鲁维(K. marxianus)KM-0的感受态细胞中,转化条件为:电压1.5 KV,脉冲时间5 ms,电阻200 Ω,电容25 μF。在含有潮霉素(100 μg / ml)的YPD培养基上培养,筛选得到阳性的转化子。本实施例筛选得到24个转化子。
[0048]电泳检测:用HPT取代Lca4后,基因片段长度差别明显,因此可以根据核酸电泳条带的大小判断是否完全取代。设计Lac4缺陷型转化子核酸电泳验证引物,如表1所示(F-Lac4check,R-Lac4check),提取各转化子基因组为模板,进行PCR扩增,扩增条件为:预变性95℃ 5 min;变性95℃ 20 s,30个循环;退火55℃ 20 s...
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[0057]实施例2 产2′-岩藻糖基乳糖的重组工程菌的设计
[0058]基于PGASO策略,组装5个基因盒(命名及顺序为:SOG418t,SOGmdt,SOWcaGt,SOFucTt,SOCDT2t),构建产2′-岩藻糖基乳糖的重组工程菌。为使各基因在宿主细胞内充分表达,每个基因都匹配了一对强启动子、终止子。
[0059]在第1个基因盒中,G418抗性筛选基因通过同源重组,与从野生型马克斯克鲁维K.marxianus KM-0基因组体外克隆的ADH2启动子和TPI1终止子首尾相接。
[0060]在第2个基因盒中,Gmd基因通过同源重组,与PGK启动子和INU1终止子首尾相接。
[0061]在第3个基因盒中,WcaG基因通过同源重组,与FKP1的启动子和终止子首尾连接。
[0062]在第4个基因盒中,FucT基因通过同源重组,与TEF启动子和TPS1终止子首尾连接。
[0063]在第5个基因盒中,CDT2基因通过同源重组,与GAPDH的启动子和终止子首尾连接。
[0064]这5个基因盒的插入的多克隆位点两端分别命名为rDNA1和rDNA2,基因盒的组装顺序和连接如图3所示,5个基因及启动子、终止子的扩增引物如表2所示,启动子、终止子的具体来源如下:乙醇脱氢酶基因ADH2(GenBank: AF225206.1)启动子,磷酸丙糖异构酶基因TPI1(GenBank: AJ577476.2)终止子;磷酸甘油酸激酶基因PGK(GenBank: XM_022822209.1)启动子,菊粉酶基因INU1(GenBank: XM_022822162.1)终止子;6-磷酸果糖激酶基因FKP1(GenBank: XM_022820285.1)启动子和终止子;翻译延伸因子基因TEF(GenBank: XP_022678358.1)启动子、海藻糖-6-磷酸合成酶基因TPS1(GenBank: XP_022678366.1)终止子;甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因GAPDH(GenBank: XP_022678116.1)启动子和终止子。
[0065]表2
[0066]引物名称碱基序列(5’ to 3’)F-G418ATGGGTAAGGAAAAGACTR-G418TTAATTTAGAAAAACTCATCGAGCF-GmdATGTCTAAGGTTGCTTTGR-GmdTTAGGATTCCAATGCGATAGF...
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[0072]实施例3 产2′-岩藻糖基乳糖的重组工程菌的验证
[0073]设计验证引物,如表4所示,以转化子KMdeLac24-FL15为模板,利用表4所示的引物进行扩增,扩增产物进行电泳检测,结果如图5所示,结果表明,核酸电泳扩增出5条与5个基因盒实际大小一致的单一条带,证明通过PGASO策略已成功按照预定顺序转入了SOG418T等5个基因盒。
[0074]表4
[0075]引物名称碱基序列(5’ to 3’)F-rDNA1GCGGCCGCCTGGTTGATCCTGCCAGTR-checkSOG418TAGCATGTAGCAAGCGAGGGCCATGF-checkSOGmdGCAGTTTCATTTGATGCTCGATGAGR-checkSOGmdCTAAACACTAAACTATGCACCAGCTCF-checkSOWcaGCATGTGCCGGTCGCTTTCCCTTTCR-checkSOWcaGCACTGGGGCAGAAGCCAGGTCTGGGF-checkSOFucTGATGAGATATACTGACACACAAAGGCR-checkSOFucTGTGGATGAGGGCCTCTCGAGTGF-checkSOCDT2GAATGCATATCGAAATGTCTGCACR-rDNA2GCGGCCGCAATGATCCTTCCGCAG
PUM
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